O Wheelhouse LMS usa Categorias/Departamentos para organizar a formação de cursos em áreas comumente intituladas dentro de uma organização. As categorias/departamentos encontram-se no Painel de Administração/Gestor ao apresentar o progresso do Pessoal; dentro da listagem do Curso de Biblioteca como cabeçalhos para organizar cursos; como cabeçalhos na página Your Courses; e identificar quais as áreas a que as pessoas são atribuídas a partir do Separador do Povo.
Quando um Gestor, Administrador ou Representante de Conta define a função de utilizador para o Manager, é-lhes exigido que selecionem um departamento para que esse gestor monitorize. Os membros do pessoal também devem ser designados um departamento para que os seus progressos na formação possam ser devidamente monitorizados pelos seus gestores. Além disso, o Wheelhouse College tem matrículas padrão para novos utilizadores, e selecionar um departamento permite que eles sejam automaticamente matriculados nos cursos apropriados e iniciar a sua formação mais rapidamente.