O Wheelhouse LMS usa Categorias/Departamentos para organizar o treinamento de cursos em áreas comumente intituladas dentro de uma organização. Categorias/Departamentos são encontrados no Painel administrador/gerente ao exibir o progresso da equipe; dentro do Curso de Biblioteca listando como cabeçalhos para organizar cursos; como cabeçalhos na página Seus Cursos; e identificar para quais áreas as pessoas são designadas a partir da Guia de Pessoas.
Quando um gerente, administrador ou representante de contas define a função de um usuário para o Gerente, ele é obrigado a selecionar um departamento para que esse gerente monitore. Os funcionários devem ser designados para um departamento também para que seu progresso de treinamento possa ser adequadamente monitorado por seus gerentes. Além disso, o Wheelhouse College tem matrículas padrão de cursos para novos usuários, e selecionar um departamento permite que eles sejam automaticamente matriculados nos cursos apropriados e comecem sua formação mais rapidamente.